Choluteca está a unos 136 km de distancia de Tegucigalpa, cerca de la frontera sur con Nicaragua. La Aldea Infantil SOS está ubicada a 1,5 kilómetros en las afueras de la ciudad, en la urbanización Miramontes. Hubo varias razones que determinaron su construcción. En primer lugar, el crecimiento del número de niños huérfanos o abandonados era constante en la región, y en segundo lugar, debía ser un proyecto que continuara las labores iniciadas con el Programa de emergencia SOS "Mitch". En octubre de 2000 se terminaron los trabajos de construcción y al mes siguiente los primeros niños pudieron instalarse en su nuevo hogar.

La Aldea Infantil SOS Choluteca se compone de 12 casas familiares, un edificio administrativo, la casa del director de la aldea, las casas para el personal, unasala para atención médica y un pabellón. El Centro Social SOS Choluteca -que asimismo se encuentra en el terreno de la Aldea Infantil SOS- es otro proyecto que también siguió al de emergencia. En este centro se encuentra una guardería con capacidad de atender durante el día a unos 150 bebés de padres que trabajan. Desde el 2005 se organizan, además, programas de hogares comunitarios junto con mujeres y familias de las comunidades cercanas. Estas instalaciones para cuidado infantil contribuyen al fortalecimiento de familias, y ayudan a evitar que los padres abandonen a sus hijos.